Чтобы из Java можно было работать с базами данных нужен драйвер, вспомогательный класс. Который будет обрабатывать подключение к БД, выполнять запросы.
Им и служит JDBC. Это нативный инструмент Java, который делает работу с базами данных легкой и простой. Ну, по-крайней мере, инкапсулирует в себе всю основную низкоуровневую работу с БД.